くるみアレルギーなどの即時型反応を示す食物アレルギーが成立するには、食物抗原蛋白（くるみに含まれるタンパク質）に対する特異的IgE抗体が作られて皮膚や粘膜にいるマスト細胞（肥満細胞とも言います）の表面について待機している段階（感作相）が起こる必要があります。この段階までは何もアレルギー反応は起きないのですが、感作された状態の人が食事などで体内に食物アレルゲン（くるみ）を取り込むと、アレルゲンがIgE抗体に結合しマスト細胞からヒスタミンなどの化学伝達物質が放出されて蕁麻疹やアナフィラキシーなどのアレルギー反応を起こします（反応相）。症状としては、口の中の違和感（かゆい、からい、ぴりぴりするなど）、唇の腫れ、蕁麻疹、腹痛、吐き気、下痢、呼吸困難、めまい、意識消失（ショック症状）など即時型の食物アレルギーによくある症状が出現します。症状の程度には個人差があり、少量で重篤な症状が出る人もいれば口の中の違和感や軽い蕁麻疹だけで済む人もいます。
くるみの特異的IgE検査では、くるみからの祖抽出抗原が用いられており、さまざまなタンパク質が含まれています。そのなかで特定の成分をアレルゲンコンポーネントと呼び、特定のコンポーネントがアレルギー反応を起こしやすいことがわかってきました。くるみでは、Jugr1（ジャグ・アール・ワン）というコンポーネントが重篤なアレルギー反応と関連することが報告されています。
初めての発症年齢は、令和３年度の消費者庁の調査では、年齢群別原因食物において、木の実類は、３－６歳では第１位を占め、１－２歳、７－１７歳では第２位を占めています。1）
卵や牛乳に比べて、初めて食べる年齢が高いことも初発年齢が高いことと関係していると思われます。まだ、くるみを食べたことのない方でJugr1の特異的IgEが陽性を示す場合は、医師に相談して慎重に開始するようにしましょう。

くるみは、和洋菓子（チョコ、クッキー、ドーナツにも）、味噌、つゆ、食用油、パン、パスタ、ドレッシング、サラダ、など実に多くのさまざまな加工品に使用されています。製品の外見からは判断できない場合も多いので、必ず原材料表示を確認しましょう。 外食などでサラダにドレッシングがかけてある場合など、原材料が確認できないメニューは要注意です。 加工食品におけるくるみの表示については、義務化されましたが、令和７年３月３１日までは経過措置期間（事業者が表示の切替えを行う期間）が設けられていますので、特定原材料の品目だけで推奨項目の表示がない加工品は要注意です。
なお、くるみとペカンナッツはIgE抗体が結合する部位の構造がよく似ているため、交差反応性があります。したがってくるみアレルギーの人はペカンナッツでもアレルギー反応を起こす危険性が高いので注意してください。ちなみにカシューナッツとピスタチオにも交差反応性があります。

国立成育医療研究センター・アレルギーセンターと株式会社ダスキンの開発研究所が家庭内のホコリ中に含まれるくるみアレルゲンに関する共同研究を行ったところ、４５家庭を対象とした調査により、家庭内における環境アレルゲンとしてのくるみアレルゲンの存在が明らかになりました。１３家庭のリビングルームのホコリと１４家庭の子どものベッドの上のホコリから、くるみアレルゲンを検出しました。家庭内におけるくるみの週間消費量が４g以上の家庭では、４g未満の家庭と比較して、ホコリ中のくるみアレルゲンの量が多く認められました。そして、くるみの主要アレルゲンであるJugr1に対する感作が陽性であった子どものベッド上のホコリ中からは、くるみアレルゲン量を多く認めました。（くるみアレルゲン２００ug/g以上の検出はJugr1感作陰性家庭からはが０％、Jugr1感作陽性家庭は５０％）。2）
これは他の食品でもそうですが、家庭内におけるくるみの消費量が多い場合、ホコリ中のくるみタンパク量も多くなる傾向があり、子どもが生活している居間や寝具のホコリに含まれるくるみタンパクから感作を受けやすくなります。
アレルゲンタンパクは炎症のある上皮から侵入すると感作を受けやすくなるので、湿疹のあるお子さんはリスクが高くなります。英国の報告ではピーナツオイルでマッサージを受けた乳児はピーナツアレルギーになるリスクが極めて高いことが示されています。3）
皮膚に塗る外用薬は自然素材だから安全という理屈は成り立ちません。食べ物は食べることで免疫寛容が誘導され食物アレルギーの予防や治療に繋がりますが、皮膚に塗った場合、炎症があると感作を受けてIgE抗体を作ってしまうリスクが高くなります。ですから食物タンパクが入っている製品は決して皮膚には塗らないようにしてください。